中國醫藥大學附設醫院質子治療中心位於台中水湳國際經貿園區內，包含在中醫大國際健康產學園區之中。

為引進尖端粒子治療技術，2016年起由蔡長海董事長率團參訪日本兵庫縣粒子線醫療中心，其後陸續參訪日本九州佐賀與大阪關西重粒子治療中心等處。經過詳盡評估，決定引進瓦里安公司Varian ProBeam®360°質子治療系統。

2024年7月中部首座質子治療中心正式啟用並開始營運，本中心包括放射腫瘤專科醫師、放射技術師、醫學物理師、腫瘤護理師、個案管理師組成的多專科團隊，不斷的提升醫療品質與技術專業，為患者打造專屬治療計畫，致力於提供尖端及全方位的醫療服務。