中國醫藥大學附設醫院 〈胸腔內科〉 於 1980 年醫院開辦，隸屬內科部。 1990 年 7 月成立 〈胸腔暨重症系〉，結合 〈胸腔內科〉 及 〈呼吸治療科〉 的業務，至此，本系已有22位主治醫師，是中台灣最具規模之胸腔科訓練醫院。 2007 年，配合癌症中心規劃出肺癌醫療團隊，以提供肺癌病患更完善的治療。
另外，依據全民健康保險「呼吸器依賴患者整合性照護計畫」，分設不同等級照護病房，包括：一般病房、加護病房及呼吸照護中心。
胸腔科病房目前分佈於第一醫療大樓8樓、立夫醫療大樓20樓和急重症大樓7樓，病患分別是一般胸腔科疾病和肺癌病人為主，總床數共約 80-100 床。 胸腔科檢查室位於兒童醫療大樓2樓與急重症大樓地下室，檢查項目包括肺功能、超音波、支氣管鏡和運動肺功能。肺復原治療室設立於復健大樓 8 樓 。
呼吸治療科服務範圍涵蓋全院呼吸衰竭病患的照顧、呼吸器的管理使用、病患手術前後的衛教與照顧、胸腔肺復原治療、氧氣與噴霧藥物的治療。
胸腔暨重症系另與本院兩個特色醫療中心 － 〈高壓氧中心〉 和 〈睡眠中心〉 密切合作。
回顧過去，醫療環境不斷變遷，胸腔暨重症系的成功，在硬體方面，歸功於醫院大力的建設及更新，投資最好的醫療及設備，讓本系能夠在短時間內突飛猛進領先其他醫院；軟體方面，歸功於完整的醫療團隊，素質整齊的主治及住院醫師陣容以及與胸腔外科、放射科及病理科的密切合作。
展望未來，胸腔暨重症系會配合醫院在癌症及急重症的發展，在服務方面提供更優質醫療品質；在教學方面秉持優良的教學傳統與口碑；在研究方面，不斷的創新與發表優異論文，將來以達成世界級的一流胸腔醫學中心為目標。
願景
我們堅持問題導向學習，以實務問題為核心，鼓勵醫師主動終身學習、批判思考、和提升問題解決能力，在此信念下，引領醫療持續進步。
使命
全體同仁秉持熱忱，追隨院策兢業戮力，為實踐醫學中心服務、教學、研究的宗旨而努力。
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